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统计fastq文件中读段的数量
阅读量:5831 次
发布时间:2019-06-18

本文共 259 字,大约阅读时间需要 1 分钟。

mycount=`cat SRR108114_new_1.fastq | wc -l`

echo 'Number of clean reads, SRR108114_new_1.fastq: '$((mycount/4)) >> SRR108114.stat
mycount=`cat SRR108114_new_2.fastq | wc -l`
echo 'Number of clean reads, SRR108114_new_2.fastq: '$((mycount/4)) >> SRR108114.stat

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